Métabolomique: un nouvel outil pour la recherche et la clinique à l’UNIL-CHUV

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Exactive Plus Orbitrap : un spectromètre de masse qui ouvre l’ère de la métabolomique © DR

La plateforme technologique qMSF (quantitative Mass Spectrometry Facility), dirigée par Bertrand Rochat, a été sélectionnée par la firme Thermofischer pour tester un nouveau spectromètre de masse avant sa mise sur le marché: un Exactive Plus Orbitrap. Celui-ci permettra de réaliser non seulement des analyses quantitatives et ciblées de médicaments et de molécules endogènes, mais également des phénotypages métaboliques. L’arrivée de cet appareillage ouvre l’ère de la métabolomique tant pour la recherche que pour les analyses cliniques de routine à l’UNIL-CHUV.

Un nouvel outil révolutionnaire
qMSF propose depuis 2003 l’analyse quantitative de différentes molécules comme les peptides naturels ou thérapeutiques, les médicaments etc. Jusqu’à présent, qMSF disposait de deux spectromètres de masse pour effectuer ces analyses. Ces deux instruments nécessitent un choix préalable des molécules à mesurer avant leur analyse, ce qui limite le nombre de composés détectés et les possibilités d’investigation. Le nouvel outil mis à disposition par l’entreprise Thermofischer propose une vraie révolution en permettant la détection, sans présélection, de toutes les molécules ionisables dans l’échantillon. La mesure simultanée de plusieurs centaines de molécules devient ainsi possible et la sélection des molécules d’intérêt se fait après l’analyse. Le screening de plusieurs centaines, voire de milliers de composés, ouvre une vraie opportunité de découvertes.

«Le labo d’accueil a été très soigneusement choisi et nous avons été les premiers en Europe à en bénéficier. Nous sommes donc très honorés de savoir que les scientifiques de Thermofisher ont la même vision du futur que nous dans ce domaine et qu’ils mettent à notre disposition cet instrument pour 12 mois», précise Bertrand Rochat, responsable de la plateforme qMSF. «Ma collaboration avec le Hugues Henry du Laboratoire de chimie clinique a été et sera très utile pour produire les premiers résultats en clinique et nous familiariser plus concrètement avec cette technologie tout à fait nouvelle au CHUV et à l’UNIL», poursuit le chercheur.

En route vers la métabolomique
Après la génomique et la protéomique, voici venue l’ère de la métabolomique. L’analyse des concentrations et des flux des métabolites permettra de définir un «profil métabolique» et de caractériser très finement le statut moléculaire d’un système biologique en identifiant l’«empreinte» d’un processus pathologique, d’une agression toxique, d’une réponse pharmacologique, d’influences génétiques ou de toute autre perturbation.

Avec la mise à disposition de ce spectromètre de masse, l’UNIL-CHUV se voit ainsi offrir l’opportunité de jouer un rôle dans le domaine encore peu exploré de la métabolomique clinique.

 
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