Postdoc en microbiologie

Agroscope recherche un/e:

Postdoc en microbiologie

Le domaine de recherche Systèmes microbiens des denrées alimentaires d’Agroscope souhaite engager un-e chercheur-euse motivé-e pour un poste de postdoc en microbiologie (Liebefeld, Suisse). Le travail de postdoc traite des questions suivantes: quels facteurs influencent la composition du microbiote dans le lait cru, quels germes ont un effet positif et comment ces germes peuvent être enrichis de manière sélective. L’objectif est de développer les bases scientifiques permettant d’optimiser à long terme la qualité, la sécurité et les aspects nutritionnels et sanitaires de la consommation de fromages au lait cru. Il existe une longue expérience par rapport à l’influence des groupes de germes individuels, qui sont déterminés au moyen de la microbiologie classique. Dans la présente étude, ces connaissances acquises dans le domaine devront être appliquées aux données issues du Next-Generation-Sequencing et/ou du High-Throughput-qPCR.
Le projet contribue de manière déterminante à la mise ne place du nouveau centre de compétences «Produits laitiers à base de lait cru» qu’Agroscope a lancé en collaboration avec l’Institut agricole de l’Etat de Fribourg en 2020. L’association d’autres partenaires de recherche est visé.

• Évaluation bioinformatique et statistique des résultats analytiques sur le microbiote du lait cru et du fromage au lait cru au moyen de la microbiologie classique ainsi que du High-Throughput Sequencing Data.
• Identification et caractérisation des groupes de germes ayant un impact favorable sur la qualité, la sécurité et la santé du consommateur de fromages au lait cru.
• Développement d’une méthode résiliente pour l’enrichissement sélectif des bactéries avec des effets positifs pouvant être utilisés lors de la fabrication artisanale du fromage et contribuant à l’authenticité et à la diversité des produits.
• Optionnel: détermination des effets de différents traitements thermiques et processus d’enrichissement sur les effets sur la santé de protéines sélectionnées dans le lactosérum.
• Collaboration scientifique à un nouveau projet COST sur le lait cru et les produits à base de lait cru si la demande déposée est avalisée.
• Publications dans des revues spécialisées de renom.
• Evaluation bioinformatique et co-auteur-e d’autres projets de recherche choisi.

• Diplôme de master universitaire (ou diplôme de fin d’études équivalent) en biologie avec spécialisation en microbiologie, biologie moléculaire ou biochimie et doctorat en sciences de la vie.
• Expériences dans le domaine de la technique de laboratoire moderne liées à des évaluations bioinformatiques complexes.
• Aptitude à travailler et à publier de manière autonome.
• Des connaissances techniques dans la génération et l’analyse de données issues du Next-Generation-Sequencing et/ou du High-Throughput-qPCR et/ou de la biochimie des protéines constituent un atout.-
• Connaissances linguistiques: en anglais impérativement, et en allemand et/ou en français souhaitées.