Doper l’efficacité du séquençage ARN de cellules uniques

Gros plan sur la microfluidique permettant la co-encapsulation déterministe de cellules uniques à des efficacités exceptionnelles. Crédit: Joern Pezoldt (EPFL) - Les bioingénieurs de l'EPFL ont trouvé un moyen d'augmenter radicalement l'efficacité du séquençage ARN de cellules uniques, un outil puissant permettant de «lire» le profil génétique d'une cellule individuelle. Le séquençage ARN de cellules uniques, «scRNA-seq» en abrégé, est une technique qui permet aux scientifiques d'étudier l'expression des gènes d'une cellule individuelle au sein d'une population mixte - ce qui est en principe la manière dont toutes les cellules cohabitent au sein des tissus humains. Le scRNA-seq, qui fait partie de la famille élargie des techniques de «séquençage ARN de cellules uniques», consiste à capturer l'ARN d'une cellule individuelle et, après plusieurs réactions de conversion moléculaire, à le séquencer. Puisque l'ARN est un intermédiaire entre gènes (ADN) et protéines, il donne un aperçu des gènes actifs et non actifs au sein d'une même cellule. Parce qu'il répertorie l'activité de tous les gènes du génome de la cellule - des milliers de gènes simultanément - le scRNA-seq est devenu le standard absolu pour définir l'état et le phénotype des cellules. Ce type de données peut révéler des types de cellule rares au sein d'une population, et même des types encore inconnus à ce jour.